Portul Senta dispune de 18.260 m² de depozite închise. În afară de cele închise, compania dispune şi de 20.000 m² de depozite deschise.
În depozitele portului se poate face primirea, depozitarea şi livrarea mărfii de diferite feluri care nu necesită condiţii speciale de depozitare. Din aceste mărfuri fac parte, printre altele, cerealele, nutreţul, pulpa de sveclă uscată, diferită marfă în vrac sau mafa ambalată în saci.
De asemenea se face depozitarea gazului petrolier lichefiat (GPL) – capacitatea 1.000 m³ – cu utilaj pentru rebordare şi transport.